Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot8Q9D8X5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnot8Q9D8X5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms