Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms