Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4bQ9D8B3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms