Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chmp5Q9D7S9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp5Q9D7S9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms