Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Capns2Q9D7J7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Capns2Q9D7J7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms