Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc94Q9D6J3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc94Q9D6J3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms