Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms