Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc39Q9D5Y1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc39Q9D5Y1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc39Q9D5Y1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc39Q9D5Y1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms