Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc81Q9D5W4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc81Q9D5W4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms