Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms