Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PrameQ9D4Z5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrameQ9D4Z5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms