Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc83Q9D4V3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms