Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efhd1Q9D4J1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efhd1Q9D4J1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms