Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pabpc6Q9D4E6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms