Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D454 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D454 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9D454 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9D454 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9D454 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D454 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9D454 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9D454 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D454 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D454 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9D454 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms