Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933425L06RikQ9D3Z8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933425L06RikQ9D3Z8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms