Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx11Q9D3G5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx11Q9D3G5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx11Q9D3G5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx11Q9D3G5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx11Q9D3G5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx11Q9D3G5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx11Q9D3G5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms