Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Stag1Q9D3E6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stag1Q9D3E6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms