Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms