Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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Krt20Q9D312 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt20Q9D312 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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