Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pramef12Q9D2F1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramef12Q9D2F1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms