Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc6bQ9D289 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc6bQ9D289 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc6bQ9D289 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms