Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem53Q9D0Z3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms