Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms