Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift27Q9D0P8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ift27Q9D0P8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ift27Q9D0P8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ift27Q9D0P8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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