Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Exosc7Q9D0M0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms