Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pbdc1Q9D0B6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms