Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc77Q9CZH8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms