Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim13Q9CYB0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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