Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2fQ9CY34 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms