Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms