Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sugt1Q9CX34 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sugt1Q9CX34 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms