Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RpainQ9CWY9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms