Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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