Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkrip1Q9CWV6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms