Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddx28Q9CWT6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms