Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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