Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NubplQ9CWD8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms