Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atxn3Q9CVD2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms