Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MINDY3Q9CV28 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms