Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms