Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms