Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sft2d3Q9CSV6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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