Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms