Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc5Q9CRA8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Exosc5Q9CRA8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms