Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms