Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PpidQ9CR16 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms