Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms