Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Riok2Q9CQS5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Riok2Q9CQS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms