Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf138Q9CQE0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf138Q9CQE0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms